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接着,磷酸化的酪氨酸位点招募并激活Grb2-SOS复合物,SOS蛋白可以激活Ras蛋白,使其从GDP结合形式转变为GTP结合形式而被激活。
激活的Ras进一步激活Raf激酶,Raf磷酸化并激活MEK,MEK再磷酸化激活ERK(属于MAPK家族)。
激活后的ERK可以转位到细胞核内,磷酸化多种转录因子,如Elk-1等,从而调控相关基因的表达,最终实现对细胞增殖与分化的调控。
在这个过程中,还存在着多个负反馈调节机制,例如ERK可以磷酸化SOS,使其活性降低,从而对整个信号通路起到反馈调节作用,确保信号传递的精准性与适度性。”
魏文胜教授听后,脸上露出了满意的笑容,点头示意张启回答正确。
这时,另一位知名的生物学教授饶子和站起身来,声音洪亮地说道:“我是饶子和教授。
张启,接下来这个问题是硕士研究生阶段的难度。
在蛋白质结构解析中,对于膜蛋白这种特殊结构类型,其结晶困难重重,试阐述目前常用的提高膜蛋白结晶成功率的策略有哪些?并且详细说明其中一种策略的作用原理。”
张启眼神专注,不假思索地回应道:“目前常用的提高膜蛋白结晶成功率的策略有多种。
比如,使用去垢剂来增溶膜蛋白,使膜蛋白从细胞膜中分离并稳定存在于水溶液环境中以便后续操作。
还有脂质立方相法,将膜蛋白重组到人工构建的脂质立方相中,模拟膜蛋白的天然膜环境,利于其形成有序的晶体排列。
以脂质立方相法为例,其原理是脂质立方相具有特殊的三维结构,能够为膜蛋白提供一个类似生物膜的疏水环境,同时其有序的脂质结构可以引导膜蛋白在其中以特定的取向和间距分布,减少蛋白分子间的无序聚集,从而增加膜蛋白分子间相互作用形成有序晶体的可能性。
在这个过程中,通过精确控制脂质的种类、比例以及实验条件如温度、压力等,可以进一步优化结晶效果。”
饶子和教授听完,不禁对张启的敏捷才思和深厚学识竖起了大拇指,现场的其他教授也纷纷点头认可。
紧接着,蒋争凡教授也开口提问:“我是蒋争凡教授,那我出一个同样硕士研究生阶段的问题。
在细胞自噬过程中,ULK1复合物是如何被激活从而启动自噬的?请详细说明其上下游的调控机制。”
张启几乎是在蒋争凡教授话音刚落的瞬间便开始作答:“在营养充足的条件下,mTORC1与ULK1复合物结合并使其磷酸化,抑制ULK1的激酶活性,从而阻止自噬的启动。
当细胞处于营养匮乏或应激状态时,mTORC1的活性受到抑制,对ULK1复合物的抑制作用解除。
同时,AMPK被激活,AMPK可以直接磷酸化ULK1,也可以磷酸化与ULK1相互作用的蛋白,如ULK1结合蛋白ATG13和ATG101,增强它们与ULK1的相互作用并促进ULK1的活化。
活化后的ULK1进一步磷酸化下游的ATG蛋白,如ATG14L、VPS34等,这些磷酸化事件共同作用,启动了细胞自噬过程中的膜泡成核、延伸等关键步骤,最终形成自噬体,包裹并降解细胞内的底物。”
蒋争凡教授面露惊色,对张启如此快速且精准的回答深感钦佩,台下的新生们也被张启的表现深深折服,原本的喧哗声变成了一片赞叹的低语。
此时,汤富酬教授站了起来,清了清嗓子说道:“我是汤富酬教授,下面这个问题可是博士研究生阶段的难度了。
你可有信心?”
话音一落,现场围观的学生们一片哗然,纷纷交头接耳,都觉得这要求实在是太苛刻了,连博士研究生的问题都拿出来考,这不是故意为难人嘛。
张启却只是微微一笑,坦然说道:“请您出题便是。”
汤富酬教授点了点头,正式出题,“在单细胞转录组测序技术中,如何克服因单细胞起始量少而导致的基因覆盖度低以及技术噪音大的问题?请阐述目前最前沿的解决方案及其技术原理和优势。”
张启镇定自若地回答:“针对基因覆盖度低和技术噪音大的问题,目前有一种基于微流控技术与独特分子标记(UMI)相结合的前沿方案。
微流控技术能够精确地操控单细胞,将其与反应试剂高效混合,减少样本损失并提高反应效率。
而独特分子标记则是在反转录过程中为每个原始的mRNA分子添加特定的标签。
这样一来,在后续的扩增和测序过程中,可以通过识别这些标签来区分真实的转录本信号和由扩增产生的噪音信号,从而有效地降低技术噪音。
通过这种方案,不仅能够显着提高基因的覆盖度,还能提升数据的准确性和可靠性,使得单细胞转录组测序结果更能反映细胞的真实转录状态,为深入研究细胞异质性等生物学现象提供有力的支持。”
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