十月初二日，慈禧太后又连发两道上谕，补授恭亲王为总管内务府大臣，全权管理负责皇宫内外事务的内务府一切事务；并授权他，全权管理宗人府银库。

这样，恭亲王集内外一切权力于一身了：首席军机大臣，负责国家军政事务；宗令，负责皇族事务；内务府大臣，负责皇宫事务，包括宫廷内外礼仪、财务、人事、禁卫、工程、日用、奖惩等等大小事务和满洲上三旗军政事务、皇室内外财务。

大臣们更为关注的是如何清理肃顺党人，是彻底收拾还是有所保留？

少詹事许彭寿深思熟虑，特地上了一道折，提出了四点建议：一是门禁宜严，二是查抄宜速，三是查办党援宜严密，四是狱中囚犯宜省释。

许詹事的这道折子，中心意思是查办肃顺私党，而且应该从速从严。

慈禧太后没有采纳这一主张，她认为应该首恶从严，协从从宽，这样既树立了权威，又打击了政敌，安定了人心。

恭亲王也很赞同太后的想法，认为当务之急是安定局面，对肃顺私党应该分清情况，区别对待。

慈禧太后于十月二日、三日，连发两道上谕，命令大臣西拉布前往北京肃顺府邸查抄家产，派遣春佑前往热河查没肃顺私寓。

这道查抄谕令，初一晚上秘密签发，行动结束之后，于初三日才送交内阁明发。

满洲王公贵族，特别是宗室成员，如果不犯叛国之罪，他们享有许多特权，主要特权就是不判死刑，不入刑部监狱，不上枷刑示众。

肃顺之流，与慈禧太后、恭亲王结怨太深，她和恭亲王自然一定要置他们于死地，以绝后患。

这样，两宫太后传下谕旨，命恭亲王会同大学士、六部、九卿、翰、詹、科、道大臣，会议如何处置肃顺、载垣、端华。

十月初五开始，恭亲王奉旨会同众大臣合议肃顺3人之罪。

肃顺等人是奉遗诏为顾命大臣的，他们的行为基本符合祖制，如何定罪？实在是难为了众人。

会议的结果，是久议不下，莫衷一是。

慈安太后心慈手软，大臣们久议不决，她没了主意，神情上似乎有点对不起八大臣。

她对慈禧太后说：妹妹，咱们已经赢了，是不是放他们一马？放了算了，都是黄带子、红带子，自家人！

慈禧太后冷冷地说：姐姐，你忘记了热河？他们竟敢那样欺负咱们，目无君上，擅入内廷！

咱们今天放了他们，他们明天就会收拾咱姐俩！

慈安太后更没了主意：那，那怎么办？

慈禧太后依旧冷冷地说：杀。