时进60年代，唐君毅的著作方向，乃渐转于哲学本身的研究这一意图早在他1955年出版的《人文精神之重建》中就已明确地表示过他说:&ot;以后拟少写此类之文章，仍回到比较更切实的学术工作&ot;他认为，&ot;返本开新&ot;的关键，不仅在于对时代病痛的反省与批导，更在于要切实地从疏理整个文化遗产的学术工作做起，庶期开出尔后学术文化乃至政治教育之具体路向基于这种认识，1961年，他出版了独具新意的两卷本《哲学概论》他在《自序》中直陈此书之方法与旨趣，&ot;是直接中国哲学之传统，以中国哲学之材料为主，而以西方印度之材料为辅于问题之分析，求近于英国式之哲学概论于答案之罗列，求近于美国式之哲学概论而各问题之诸最后答案，则可配合成一系统，求近德国式之哲学概论期在大之可证成中国哲学传统中之若干要义，小之则成一家之言&ot;他一反时人纯以介绍西方哲学为内容的写法，而是熔中、西、印三方面哲学思想于一炉，并给以各家应有之地位这确是一项开创性的工作，迄今为止，仍是同类著作中独一无二之著作

自1966年至1975年，唐君毅耗时整整10年，终于完成《中国哲学原论》这本煌煌巨作全书共分导论篇、原性篇、原道篇、原教篇四部分，共6大册3000多页2000余万字，曾一版再版《中国哲学原论》摆脱了胡适、冯友兰研究中国哲学史以时代为线索的旧体例，而以中国哲学的基本范畴为中心，通过对中国哲学之主要观念进行文字的训诂、义理的辨析以及对其提出、发展和演变的历史脉络的考察，揭示了中国哲学的基本精神和逻辑发展，阐幽发微，博古通今，被学术界誉为中国哲学研究的里程碑

1975年，唐君毅出版了《中华人文与当今世界》因感念于&ot;中国文化之花果飘零&ot;，而大声疾呼华夏族民应&ot;灵根自植&ot;，重树雄心，宏扬我中华文明于世界，其文由情及理，以理涵情，读之令人感奋1976年，他在医院的病榻上最后完成《生命存在与心灵境界》，并于次年出版这部长达1200余页的巨著是他一生学术思想的总结他在书中一方面解答了形上学与知识所引发的种种问题，另一方面则着重论述了&ot;生命存在&ot;与&ot;道德自我&ot;之关系在他看来，&ot;生命存在&ot;涵盖着&ot;道德自我&ot;，但绝不等于&ot;道德自我&ot;，而是有着更为丰富的内涵他认为，生命存在表现为种种心灵活动（而道德活动仅是一个方面），相对于不同的心灵活动遂有不同的境界东西方不同的学术派别和宗教派别，都体现了人类心灵活动的不同方面和层次尽管表现有所不同，但都是同一生命存在的展开基于这种认识，他依据生命存在之三向，拓展出心灵之九境:初三境为万物散殊境、依类成化境、功能序运境，此三境重在客体，周觉他境，是人之心灵相应于客观境界的个体、事物的共同性相、个体之间的因果关系而分别形成的;中三境为感觉互摄境、观照凌虚境、道德实践境，此三境重在以主摄客，属自觉境，是人之心灵反省观照主观境界的感觉活动、理解活动及道德理性的实践要求而分别形成的;后三境为信仰上帝的归向一神境、皈依涅槃的我法二空境和以尽心、知性、知天为归趋的天德流行境，三者皆为超自觉境，是人之心灵超越了主客之相对，属&ot;以主为主&ot;的绝对主体境

在这里，他把以尽心、知性知天为归趋的道德实践视为人之心灵的最高境界，从而肯定了道德自我在人类心灵活动中的主导地位，这充分体现了作者作为一名儒者的最后立场，此书既是他一生学术思想的结晶，也标志着他哲学思想体系的最终完成

唐君毅是一位仁者型哲学家，一位一生践仁尽性、躬行实践的当代儒者其一生抱负宏大，常以&ot;天降任于斯人&ot;自省，无论其为学与为人，皆体现着对中华文化及吾族先民所开拓、生活的祖国河山的深深的爱他在《中华人文与当今世界》

中曾说:&ot;我对中国之乡上与固有之人文风教之怀念，此实是推动我之谈一切世界中国文化问题之根本动力所在&ot;这种爱是深沉的，厚重的，也是广阔的，博大的，至死不渝到了&ot;痴心&ot;的程度1976年，他对学生谈及《中国文化之花果飘零》时，两眼湿润，泫然欲涕，他在去世前重述1957年赴美与已故著名哲学家威廉柯敬谈中国文化的沦落的情形时，禁不住怆然下泪当他听说文化大革命中大破&ot;四旧&ot;，大量文物遭毁时，忧心如焚，并为孔子遭到批判而感愤不已而当他去世前一日在病榻上听说大陆《历史研究》上刊文开始恢复孔子名誉时，激动不已，顿感欣慰，甚为中国文化之前途而庆幸，并将自己的著作立即检册分装成两套，寄送给北京图书馆和南京大学图书馆他因局处港岛，常自叹如&ot;花果飘零&ot;，只能苍茫北望故土，而对中共多有批评，但他绝不似其他许多右派人士那样完全否定中共，而是批评中有肯定，有希望他经常对新亚的学生说:&ot;一旦中共政权变得开放，则新亚培育出来的学生，大可回到祖国的学校中去教书，提倡人文精神&ot;观其一生治学，本是以立足于人生理想，开辟生命之本源，建立道德理想的人文世界，来启导吾民族无限向上向前的生机为鸽的的

1976年秋，唐君毅赴台动肺癌大手术，致使身体耗损很大，但授课著述却未尝一日间断如此劳攘损心，终致身心俱瘁1978年2月2日凌晨6时，因癌疾急剧恶化，医治无效，逝于香港浸会医院